椰视频 | 海南医学院专家组夜以继日 26小时完成海口确诊病例溯源

[探索] 时间:2024-05-09 09:01:06 来源:蓝影头条 作者:知识 点击:140次

原标题:椰视频 | 海南医学院专家组夜以继日 26小时完成海口确诊病例溯源

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新海南客户端、椰视南海网、频海南国都市报8月4日消息(记者王洪旭 实习生羊祖燕)“仪器检测正常”“实验室已准备好!南医”……8月1日,学院海南省海口市发现1例外省输入本土新冠肺炎确诊病例(轻型),专家组夜当天上午10点多,继日海南医学院接海南省新冠疫情防控工作指挥部通知,完成要求尽快确认该病例毒株来源及遗传特征,海口为疫情防控决策提供科学依据。接到通知后,确诊海南医学院新冠病毒测序专家组立即响应,病例一场与时间赛跑的溯源攻坚战打响。

经过26小时的椰视“战斗”,专家们完成确诊病例基因测序溯源,频海初步确认该毒株属于印度德尔塔(Delta)变异株。南医

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。学院记者 李昊 摄

8月4日,新海南客户端、南海网、南国都市报记者专访海南医学院新冠病毒测序专家组成员。记者 李昊 摄

9名专家快速集结 有的远程参与

新冠病毒基因测序,相当于给病毒做“亲子鉴定”,溯源结果可为全省疫情防控策略提供重要科学依据。

1日上午,接到通知后,海南医学院党委书记杨俊、校长赵建农立即指挥协调,将已经放暑假的专家快速集结,组织专车运送标本,启动设备,开启测序工作程序。

海南医学院新冠病毒测序小组微信群,也顿时热闹起来,9名专家各司其职。海南医学院副校长、新冠病毒测序小组执行组长吕志跃说:“大家尽快启动相关工作,安全规范操作。”

记者采访海南医学院副校长、新冠病毒测序小组执行组长吕志跃。记者 李昊 摄

“当时我在儋州,收到消息我就立即赶回海口。”海南医学院热带转化实验室博士生任广旭说,虽然已经放暑假,但他随时待命,只要有需要就立即投入工作。他主要负责新冠病毒核酸标本的转运,需专车专人完成,此前的两次标本转运也是由他完成。

任广旭说,新冠病毒核酸标本转运需要用负压型转运车冷链运输,其中标本箱的温度要保持在4℃以下,如果发现温度有升高,要及时加冰降温。

测序成员易国辉、张云霞、方星悦在海口,他们立即回学校投入工作,先做好实验室环境消杀、启动实验室仪器。

当时,海南医学院生物医药资源大数据中心李永生教授,远在黑龙江省哈尔滨市,通过远程参与数据分析,博士生潘涛在海南医学院配合李教授,实现无缝衔接,开展数据分析。

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄

夜以继日 26小时完成基因测序溯源

8月1日下午6点,任广旭将新冠病毒核酸标本hu-1运送至海南医学院P2实验室,早已做好准备的测序成员易国辉、张云霞、方星悦立即投入工作,建库、质检、上机......

海南医学院科学实验中心副研究员易国辉说:“新冠病毒经过灭活后提取的核酸,是没有传染性的,在学校实验室做也比较安全。采用高通量测序技术对新冠病毒溯源,关键的环节是对新冠病毒核酸富集,由于海口本例确诊病例病毒核酸检测ct为19,病毒载量较高,操作起来速度比较快。”

易国辉说,从1日下午6点进入实验室,晚上12点将标本放上机器进行测序。每一个环节都安全、规范、严谨而流畅,20个小时即获得了高质量测序数据。

记者采访海南医学院科学实验中心副研究员易国辉。记者 李昊 摄

获得数据后,测序队员第一时间将数据送往数据分析室,李永生、尹飞飞对数据进行过滤、拼接、可靠性验证后开展序列比对及进化树构建分析,最终数据及检测报告由吕志跃副校长进行解读及审核,初步确认该毒株属于印度德尔塔(Delta)变异株。8月2日晚,海南医学院正式向海南省新冠疫情防控工作指挥部和海南省卫健委报送了检测报告。

记者采访海南医学院热带转化医学教育部重点实验研究员尹飞飞。记者 李昊 摄

2日晚上11点多,海南省卫健委向社会发布消息:经对阳性样本基因测序,初步判定为德尔塔(Delta)变异株。

“感谢各位组员夜以继日,测序准确高效。”吕志跃说,本次溯源工作之所以能在26小时内高效完成,一方面得益于校领导的高度重视和积极协调,增加专家力量,保证工作开展,另一方面在于海医测序小组专家24小时连轴工作,以最快速度对输入性病例进行测序溯源。

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄

关键时刻显担当 多次高质量完成新冠病毒溯源

经了解,海南医学院新冠病毒测序小组成立于2020年8月,目前拥有二代测序和三代测序两个测序平台,组成了一支包括病毒核酸转运、病毒测序、生物信息学分析等成员的专业团队。该团队成立以来,申请获得海南省新冠病毒核酸运输及测序资质,多次高质量完成海南省新冠疫情防控工作指挥部交办的多起新冠病毒核酸测序任务。

去年10月,对来自境外的一名母亲和女儿进行核酸样本采集,完成测序鉴定;今年4月,对多名外籍船员采集核酸样本,开展基因测序和溯源,为当时疫情防控提供有力支撑。

吕志跃提醒,德尔塔变异株具有传播速度快、传染能力强、感染早期症状不明显等特点,公众们一定要提高警惕,做好个人防护,要戴好口罩、减少非必要外出、少参加聚集性活动;要及时接种疫苗,可以很好地保护自己和他人。

“针对新冠病毒的测序和溯源,可为海南省疫情防控提供关键的科学依据。”吕志跃表示,海南医学院病毒测序小组不仅可以对新冠病毒进行测序溯源,还可以对埃博拉、禽流感、登革热等其他突发、新发、输入性传染病的病原体进行快速、精准的鉴定和溯源。

关键时刻显担当,为疫情防控贡献智慧。目前,海南医学院在学校党委领导和统筹部署下搭建了基因测序的技术平台,拥有技术储备、人才储备。实行“平战结合”的原则,测序成员平时开展各自承担的教学、科研和临床工作,一旦有突发新发输入性、传染性病例,可以第一时间响应,第一时间投入到测序和溯源工作中。

海南医学院新冠病毒测序专家组成员在做确诊病例基因测序工作。记者 李昊 摄(王洪旭)

(责任编辑:休闲)

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