构建高密度基因型图谱 辰山植物园科研人员合作攻克异交多倍体遗传定位难题

[知识] 时间:2024-05-03 00:58:12 来源:蓝影头条 作者:休闲 点击:115次

原标题:构建高密度基因型图谱 辰山植物园科研人员合作攻克异交多倍体遗传定位难题

东方网记者柏可林1月17日报道:近日,构建高密Molecular Plant在线发表了辰山植物园(中国科学院上海辰山植物科学研究中心)旋花科进化组与上海师范大学黄学辉团队、度基定位中国林科院、因型园科研人员合遗传中国科学院分子植物科学卓越创新中心等多家单位合作的图谱题为“Genome-wide identification of agronomically important genes in outcrossing crops using OutcrossSeq”的文章。该研究针对异交植物的辰山三类实验群体,开发了一套用于构建高密度基因型图谱的植物作攻新方法:OutcrossSeq。该方法有望提高异交植物中基因分型、克异定位和遗传育种的交多效率。

OutcrossSeq生成的倍体高质量基因型图谱,结合实验群体的难题表型考察,可以直接用于高精度的构建高密遗传定位。以其中最具挑战的度基定位六倍体番薯为例:研究人员对番薯群体的各类农艺性状(叶形,叶色,因型园科研人员合遗传块根数量,图谱块根皮色等)及基因表达量数据进行了考察和遗传定位,辰山鉴定到控制这些性状的遗传位点和候选基因,该方法不仅创新地解决了异交多倍体物种遗传定位和功能基因定位的难题,更重要的是为众多异交植物中复杂性状的遗传解析和分子育种以及基因组选择育种提供了一套高效、精准的解决方案。

上海师范大学研究生陈蒙娇、辰山植物园范维娟博士和中国林科院纪飞扬为论文共同第一作者。辰山植物园颜梦晓博士参与了该研究。上海师范大学黄学辉教授、辰山植物园杨俊研究员、中国林科院裴东研究员、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究员为论文共同通迅作者。研究得到了国家重点研发计划、辰山专项和科学院等项目的资助。(柏可林)

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